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簡(jiǎn)要描述:scanR篩選工作站將基于顯微鏡設(shè)置的模塊化和靈活性與高內(nèi)涵篩選需求的自動(dòng)化、速度和效率相結(jié)合。模塊化設(shè)計(jì)適合標(biāo)準(zhǔn)分析和分析開發(fā),讓scanR工作站適用于研發(fā)應(yīng)用或多用戶環(huán)境。
靈活的模塊化硬件
scanR篩選工作站將基于顯微鏡設(shè)置的模塊化和靈活性與高內(nèi)涵篩選需求的自動(dòng)化、速度和效率相結(jié)合。模塊化設(shè)計(jì)適合標(biāo)準(zhǔn)分析和分析開發(fā),讓scanR工作站適用于研發(fā)應(yīng)用或多用戶環(huán)境。
綜合性軟件
scanR解決方案靈活開放的設(shè)計(jì)讓其成為日常和*級(jí)應(yīng)用的有效工具。其旨在滿足現(xiàn)代細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)、1.系統(tǒng)生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中的定量成像和圖像分析要求。
2.生物樣品的全自動(dòng)圖像采集和數(shù)據(jù)分析
3.針對(duì)多孔板、載玻片和定制陣列而設(shè)計(jì)
4.用于生物功能測(cè)定的強(qiáng)大分析模塊
5.適合分析開發(fā)和高內(nèi)涵篩選
6.可用于固定細(xì)胞和活細(xì)胞
分析示例
在藥*發(fā)現(xiàn)篩選中,已建立的協(xié)議可用于顯示化合物在細(xì)胞水平的生物化學(xué)作用。可以利用一系列標(biāo)準(zhǔn)化分析準(zhǔn)確評(píng)估基因表達(dá)水平的藥*誘導(dǎo)變化。scanR解決方案在測(cè)量細(xì)胞凋亡、微核或DNA片段化(彗星試驗(yàn))的常規(guī)篩選方面表現(xiàn)出色,并涵蓋了許多研究領(lǐng)域的各種篩選應(yīng)用。
·細(xì)胞計(jì)數(shù)
·基因表達(dá)
·細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸
·易位
·細(xì)胞增殖
·早幼粒細(xì)胞白血病(PML)身體測(cè)定
·細(xì)菌和病毒感染試驗(yàn)
·細(xì)胞周期分析
·細(xì)胞陣列篩選
·蛋白質(zhì)定位和共定位
·包括動(dòng)力學(xué)分析以及對(duì)所得響應(yīng)曲線圈門的活細(xì)胞測(cè)定
·多色分析
·稀有事件分析
·自動(dòng)FISH分析
·組織切片中的熒光分析
·細(xì)胞遷移
靈活的模塊選項(xiàng)
scanR的設(shè)計(jì)不僅滿足全自動(dòng)高內(nèi)涵篩選系統(tǒng)的特定速度、耐久性和可靠性要求,還具備無(wú)y倫b的靈活性和適應(yīng)性以及廣泛的擴(kuò)展能力。這些讓scanR能夠匹配任何應(yīng)用和預(yù)算的規(guī)范要求。其他選項(xiàng)列表包括諸如基于深度學(xué)習(xí)技術(shù)的自主學(xué)習(xí)顯微鏡模塊、使用動(dòng)力學(xué)模塊測(cè)量動(dòng)力學(xué)參數(shù)的模塊、高速3D反卷積模塊、基于IX83的紅外(IR)激光硬件自動(dòng)聚焦的集成ZDC等等。
圈門和分類
1.基于流式的強(qiáng)大數(shù)據(jù)分析概念已成功應(yīng)用于大圖像數(shù)據(jù)集分析的需求。
2.多維圖像數(shù)據(jù)以二維散點(diǎn)圖或一維直方圖顯示;可使用圖形工具選擇感興趣的聚類數(shù)據(jù)群
3.來自不同散點(diǎn)圖的圈門可以與布爾運(yùn)算組合創(chuàng)建復(fù)雜分類方案
分層圈門方法可以直觀地選擇群,也可以直接畫廊展示。
目標(biāo)檢測(cè)與分析
1.強(qiáng)大的目標(biāo)檢測(cè)模塊可以分割細(xì)胞核、細(xì)胞或其他結(jié)構(gòu)
2.選擇多種檢測(cè)算法并根據(jù)感興趣的目標(biāo)進(jìn)行調(diào)整
3.基于分割結(jié)果,可從超過100個(gè)目標(biāo)參數(shù)列表中選擇所要提取的特征
4.助力各類基于細(xì)胞的分析
下面圖像截屏詳細(xì)說明了scanR采集數(shù)據(jù)后對(duì)圖像的檢測(cè)和分割。由德國(guó)海德堡EMBL R. Pepperkok博士提供。
即時(shí)質(zhì)量控制
1.圖像和目標(biāo)與其相關(guān)數(shù)據(jù)點(diǎn)相互關(guān)聯(lián):
2.單擊數(shù)據(jù)點(diǎn)則會(huì)在顯示窗口中加載相關(guān)圖像并突出顯示相關(guān)對(duì)象
3.單擊圖像顯示窗口中的對(duì)象可突出顯示散點(diǎn)圖和直方圖中的相關(guān)數(shù)據(jù)點(diǎn)
4.創(chuàng)建門控?cái)?shù)據(jù)群或選定的所有圖像的圖庫(kù)視圖,從而便于將大圖像集與相關(guān)信息進(jìn)行直接、可視化的比較
結(jié)果會(huì)在熱圖中可視化顯示或輸出到表格中。顯示全孔概覽非常簡(jiǎn)單。
用動(dòng)力學(xué)模塊測(cè)量動(dòng)力學(xué)參數(shù)
1.可以通過時(shí)間變量對(duì)活細(xì)胞、細(xì)胞核和其他目標(biāo)進(jìn)行分類
2.根據(jù)隨著時(shí)間推移測(cè)量的值(諸如強(qiáng)度、面積、比率、形狀因子等平均靜態(tài)參數(shù))評(píng)估跟蹤曲線
3.隨著時(shí)間變化評(píng)估和分析諸如強(qiáng)度或熒光標(biāo)記強(qiáng)度、位置、大小或形狀等靜態(tài)參數(shù)
4.曲線濃縮為單一特征值(動(dòng)力學(xué)參數(shù))
5.在1D或2D直方圖中繪制動(dòng)力學(xué)參數(shù),并根據(jù)其特定的時(shí)間變量繪制門群
表達(dá)FUCC(CA)生物傳感器的hES細(xì)胞。由英國(guó)倫敦弗朗西斯克里克研究所Silvia Santos博士提供。
兩個(gè)系統(tǒng)的故事
1.在與scanR解決方案相同的系統(tǒng)上運(yùn)行奧林巴斯cellSens活細(xì)胞成像軟件,您就可以同時(shí)使用相同的設(shè)置進(jìn)行篩選和*端成像
2.利用2D和3D約束迭代反卷積算法,為苛刻的篩選應(yīng)用獲取接近共焦品質(zhì)的圖像細(xì)節(jié)
3.快速且便利的算法可以消除離焦模糊以及背景,從而突出重要的結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)
4.有助于進(jìn)行要求高分辨率結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)的深度分析
自主學(xué)習(xí)顯微鏡
經(jīng)過*次性培訓(xùn)階段之后,scanR AI能夠讓系統(tǒng)通過將所學(xué)習(xí)的分析協(xié)議整合到基于分析的工作流中實(shí)現(xiàn)新數(shù)據(jù)的自動(dòng)分析。由于用戶在訓(xùn)練實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)上掌握*全控制權(quán),并且在訓(xùn)練階段可以加入許多具有挑戰(zhàn)性的分析條件,因此提高了分析結(jié)果的準(zhǔn)確性和魯棒性。所學(xué)到的AI分析協(xié)議可以通過軟件*有的數(shù)據(jù)探索和分析界面進(jìn)行深入、輕松的驗(yàn)證,確保您對(duì)AI結(jié)果充滿信心。
使用自主學(xué)習(xí)顯微鏡生成的AI模型對(duì)無(wú)熒光染色的明場(chǎng)圖形進(jìn)行分析。Hela細(xì)胞的細(xì)胞核在訓(xùn)練階段進(jìn)行GFP標(biāo)記,以此顯示系統(tǒng)如何對(duì)明場(chǎng)圖像進(jìn)行分析。一種*新思維方式自主學(xué)習(xí)顯微鏡為高內(nèi)涵分析拓展了*新的視野。應(yīng)用范圍涵蓋了從以前不可能完成的圖像分割任務(wù)到極低信號(hào)水平的定量分析、簡(jiǎn)化染色方案、無(wú)標(biāo)記分析等。
應(yīng)用示例:在不同信號(hào)水平下對(duì)細(xì)胞核的強(qiáng)大分割,能夠大幅減少定量分析的曝光量。
技術(shù)參數(shù)
項(xiàng)目 | 參數(shù) |
---|---|
scanR篩選系統(tǒng) | 基于顯微鏡的生命科學(xué)應(yīng)用篩選系統(tǒng)平臺(tái) 靈活性:可根據(jù)應(yīng)用要求*確調(diào)整系統(tǒng)配置 性能和耐用性:*端系統(tǒng)整合理念,實(shí)時(shí)部件并聯(lián)運(yùn)行,使得滿足高通量篩選應(yīng)用的平臺(tái)開放性和可靠性優(yōu)勢(shì)合二為一 滿足篩選應(yīng)用的吞吐量和可靠性需求 |
顯微鏡鏡架 | 奧林巴斯倒置*端顯微鏡IX83,單層或雙層機(jī)架 電動(dòng)載物臺(tái), 適用于IX83的MarzhauserSCAN IM 120 x 80 |
熒光LED選項(xiàng) |
Lumencor SpectraX: 6個(gè)獨(dú)立的LED通道 CoolLED pE-300ultra: 3個(gè)獨(dú)立的LED通道 針對(duì)應(yīng)用優(yōu)化的帶通濾光片 壽命> 20,000小時(shí) |
透射光 照明選項(xiàng) |
透射照明僅用于目視觀察(無(wú)透射光篩選) 適用于篩選和目視觀察的透射光照明,包括快門(支持透射光篩選) 可選DIC(微分干涉)或相襯觀察 |
硬件控制以及 系統(tǒng)同步 |
帶有單獨(dú)CPU的實(shí)時(shí)控制器,獨(dú)立于成像PC計(jì)算機(jī)的操作系統(tǒng) 時(shí)間分辨率: 1毫秒 計(jì)時(shí)精度: < 0.01毫秒 硬件同步多任務(wù)采集(照明控制、發(fā)射濾光片、快門等) 通過外部觸發(fā)器*確控制相機(jī) |
相機(jī)選項(xiàng) | Hamamatsu ORCA FLASH 4.0 V3,配有大型18.8 mm傳感器芯片的高靈敏度冷卻sCMOS相機(jī) Hamamatsu ORCA FLASH 4.0 LT PLUS,配有大型18.8 mm傳感器芯片的高性價(jià)比sCMOS相機(jī) Hamamatsu ORCA R2,高靈敏度冷卻CCD相機(jī) Hamamatsu C8484,高靈敏度CCD相機(jī) |
物鏡選項(xiàng) | “薄”底(0.1 - 0.2 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(2x,4x,10x,20x,40x,60x,100x)的物鏡 “厚”底(~1 mm)厚度的塑料底板和載玻片(2x,4x,10x,20x,40x,60x)的物鏡 “薄”底的(0.1 - 0.2 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(10x,20x,40x)的相襯物鏡 “厚”底的(~1 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(10x,20x,40x)的相襯物鏡 |
濾光片組 | 單帶通濾光片組(根據(jù)要求提供規(guī)格) 多帶通濾光片組(根據(jù)要求提供規(guī)格) |
scanR系統(tǒng) 軟件 |
2個(gè)獨(dú)立軟件模塊:scanR采集軟件和scanR分析軟件 陰影校準(zhǔn)流程,彌補(bǔ)采集時(shí)或采集后的陰影并優(yōu)化局部熒光強(qiáng)度的均勻性 軟件模塊可以安裝在相同或不同的工作站上(64位Windows 10系統(tǒng) ) |
scanR采集 軟件 |
面向工作流的配置和用戶界面 功能強(qiáng)大的軟件自動(dòng)對(duì)焦程序可與選配紅外激光硬件自動(dòng)對(duì)焦功能、二步粗和細(xì)自動(dòng)對(duì)焦、基于對(duì)象的自動(dòng)對(duì)焦或基于圖像的自動(dòng)對(duì)焦結(jié)合使用 具有預(yù)定義格式(載玻片、多孔板)的板管理器,和用于創(chuàng)建和編輯自定義格式(斑點(diǎn)陣列)的編輯界面 用于補(bǔ)償陰影并優(yōu)化空間強(qiáng)度均勻性的陰影校正 時(shí)間序列篩選,Z-stack篩選,多色篩選(無(wú)限量的采集通道) 支持集成到自動(dòng)化樣品制備線中,例如用于液體處理的腳本化接口 |
scanR分析 軟件 |
用于標(biāo)準(zhǔn)測(cè)定和測(cè)定開發(fā)的自動(dòng)化圖像和數(shù)據(jù)分析 在線和離線多核分析 圖像處理、圖像分析、顆粒檢測(cè)、參數(shù)提取和計(jì)算 細(xì)胞計(jì)數(shù)數(shù)據(jù)探索、分析、圈門和分類 強(qiáng)大靈活的圈門概念 ,包括自動(dòng)化群檢測(cè)等 數(shù)據(jù)點(diǎn)、對(duì)象和圖像之間的直接關(guān)聯(lián) 基于分析的工作流和先進(jìn)的科學(xué)分析開發(fā)功能 |
計(jì)算機(jī) | 成像計(jì)算機(jī)(*新*代PC計(jì)算機(jī)),64位Windows 7 操作系統(tǒng) |
其他選項(xiàng) | scanR AI深度學(xué)習(xí)解決方案 延時(shí)動(dòng)力學(xué)分析模塊 - 一種*特的細(xì)胞計(jì)數(shù)方法,可以更好地分析和了解活細(xì)胞動(dòng)力學(xué) 3D反卷積模塊(需要64位操作系統(tǒng)) 配有一個(gè)或兩個(gè)攝像頭的Yokogawa®CSU-W1®共聚焦選項(xiàng) 兩個(gè)攝像頭同時(shí)采集 基于奧林巴斯IX83顯微鏡系列ZDC的紅外激光硬件自動(dòng)對(duì)焦功能 cellVivo孵育系統(tǒng) 板載機(jī)器人 編碼變倍器IX3-CAS 用于“Sedat”配置高速成像的快速發(fā)射濾光片轉(zhuǎn)盤(FFWO) 定制:硬件、軟件、分析 其他scanR分析工作站 scanR分析軟件的第er個(gè)許可證 |
一套設(shè)置包含2個(gè)系統(tǒng) | 可與cellSens活細(xì)胞成像軟件結(jié)合使用,從而實(shí)現(xiàn)*端成像系統(tǒng)的q面通用性 |
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